本文標(biāo)題:染色體彩繪一般用于鑒定含高度保守基因的細(xì)菌
信息分類:站內(nèi)新聞 新聞來源:未知 發(fā)布時(shí)間:2017-8-26 0:31:13
染色體彩繪一般用于鑒定含高度保守基因的細(xì)菌
染色體彩繪及原位反轉(zhuǎn)錄
另外兩種FISH技術(shù)是染色體彩繪(chromosome painting)和原
位反轉(zhuǎn)錄(in situreverse transcription, ISRT)。前一種技術(shù)用
于鑒定自然樣品中微生物群落的特殊基因,而后一種鑒定特殊mRNA
(即已經(jīng)表達(dá)的基因)。
染色體彩繪是將一段寡核昔酸探針或者將一個(gè)完整基因、一系
列基因、甚至整個(gè)基因組用一定方法消化得到的小探針與熒光標(biāo)簽
結(jié)合,然后將這些探針與自然樣品中微生物的DNA雜交.染色體彩繪
一般用于鑒定含有特殊高度保守基因的細(xì)菌,如編碼固氮酶基因、
編碼光合作用反應(yīng)中心的基因、編碼特殊自養(yǎng)途徑的基因,在樣品
中根據(jù)熒光細(xì)胞的數(shù)目可分別估算固氮菌、光合細(xì)菌或自養(yǎng)菌的數(shù)
目。
原位反轉(zhuǎn)錄(ISRT) FISH與染色體彩繪不同,它用于檢測(cè)自然
樣品中細(xì)胞的基因表達(dá).這種方法使用一種可與樣品細(xì)胞中已轉(zhuǎn)錄
的特殊mRNA雜交的探針,一旦探針發(fā)生作用時(shí),將進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成
互補(bǔ)的DNA,并通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增DNA,隨后擴(kuò)增的DNA再與
熒光探針反應(yīng),ISRT FISH一般用于研究自然群體中控制基因表達(dá)的
因子,并觀察特殊基因轉(zhuǎn)錄對(duì)樣品產(chǎn)生的影響。
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